酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢在低pH条件下萌发的蛋白组学研究PDF格式文档图书下载

第一章 绪论 1

一、酸土脂环酸芽孢杆菌 1

（一）酸土脂环酸芽孢杆菌的特性 1

（二）酸土脂环酸芽孢杆菌的耐热性 2

（三）酸土脂环酸芽孢杆菌的危害 4

（四）酸土脂环酸芽孢杆菌的鉴定与检测 6

（五）酸土脂环酸芽孢杆菌的控制 7

二、细菌芽孢的结构及生理特性 10

（一）芽孢结构 10

（二）芽孢形成 12

（三）芽孢复苏 14

三、非标记蛋白组学分析 17

（一）基于鉴定蛋白的肽段数的定量方法 18

（二）基于质谱峰强度的定量方法 19

第二章 营养因子对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响 21

一、材料与方法 22

（一）材料与仪器 22

（二）培养基制备 23

（三）试验方法 23

（四）数据处理 25

二、结果分析 26

（一）酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成 26

（二）碳源对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响 27

（三）氮源对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响 28

（四）无机盐对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响 29

（五）不显著因素交互作用对酸土脂环酸芽孢杆菌生长和芽孢形成的影响 32

三、结论 34

第三章 pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发的影响 35

一、材料与方法 36

（一）主要仪器 36

（二）菌种与培养基 36

二、试验方法 36

（一）芽孢收集 36

（二）pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发率的影响 38

（三）pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发形态的影响 38

三、结果与分析 38

（一）pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发率的影响 38

（二）pH对萌发过程中的酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢形态的影响 39

四、讨论 42

第四章 Label-free技术筛选酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢低pH下萌发过程的差异表达蛋白 44

一、仪器和试剂 45

二、试验方法 46

（一）菌体蛋白样品的制备、定量和检测 46

（二）蛋白质的FASP酶解 46

（三）酶解产物的LCMS/MS分析 47

（四）Maxquant的非标记分析 47

（五）生物信息学分析 47

（六）RNA提取及实时定量PCR验证 48

（七）数据分析 50

三、结果与分析 50

（一）总蛋白浓度及各组样品平行性 50

（二）LC-ESI-MS/MS分析芽孢在低pH下萌发时的差异表达蛋白 51

（三）芽孢萌发相关蛋白的生物信息学分析 51

（四）实时定量PCR验证显著差异蛋白的基因表达 53

四、讨论 53

附表 60

附表1 差异表达蛋白 60

附表2 KEGG通路分析 67

参考文献 75

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