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第一章 绪论 1

第一节 基因组学的历史回顾 1

1对“基因”的认识过程 1

2基因组学的产生和发展 9

3我国基因组学的发展 13

第二节 基因组学的研究内容和方法 17

1结构基因组学的研究方法 18

2功能基因组学的研究方法 29

3比较基因组学的研究方法 47

第三节 基因组学对生命科学的重要意义及发展趋势 49

1基因组学将揭开生物进化和生命起源的奥秘 50

2基因组学将开创发育生物学的新时代 51

3基因组学将带动其他学科的发展 51

4基因组学前景展望 52

主要参考文献 55

第二章 人类基因组计划（HGP） 64

第一节 HGP简介 64

第二节 HGP进展与未来 66

1HGP的起源 66

2HGP的启动及发展 67

3人类基因组图谱的初步分析结果 69

4人类后基因组研究 70

第三节 HGP对人类的重要意义 71

1HGP对人类生命的重新诠释 71

2HGP对人类疾病基因研究的贡献 72

3HGP促进生命科学工业的形成 72

第四节 我国对HGP的贡献 73

11％的测序任务 74

2人类基因的克隆鉴定 75

3中国人群的遗传学关系研究 79

4“炎黄计划” 79

5“千人基因组计划” 80

第五节 HGP相关的伦理学问题 81

1HGP引发的伦理焦点 81

2道德与法律对HGP的伦理约束 92

3开展平等互利的国际合作 94

4破除“基因决定论” 95

第六节 HGP对生物信息学提出挑战 96

1什么是生物信息学 96

2生物信息学发展的必要条件 97

3生物信息学研究可能面临的困难 97

4生物信息学的发展展望 99

第七节 人类基因组多样性研究 100

1人类基因组多样性计划 100

2人类基因组多样性计划的意义 101

3我国人类基因组多样性计划研究概况 102

4人类基因组多样性研究的未来发展 102

第八节 模式生物基因组计划 103

1模式生物 103

2模式生物基因组计划 104

3模式生物基因组计划的研究进展 105

4模式生物基因组计划的应用前景 109

主要参考文献 110

第三章 植物基因组计划 113

第一节 概述 113

1植物基因组计划的启动 113

2植物基因组计划研究进展 115

第二节 水稻基因组计划 120

1水稻遗传图谱 121

2水稻物理图谱 122

3水稻序列图谱 123

4水稻转录图谱和重要功能基因研究 127

第三节 小麦基因组计划 131

1小麦遗传图谱 132

2小麦物理图谱 136

3小麦序列图谱 138

4小麦转录图谱和重要功能基因研究 139

第四节 玉米基因组计划 144

1玉米遗传图谱 145

2玉米QTL研究 146

3玉米物理图谱 150

4玉米序列图谱 150

5玉米转录图谱和重要功能基因研究 151

第五节 蔬菜基因组计划 156

1番茄基因组计划 157

2马铃薯基因组计划 169

3其他蔬菜基因组计划 177

4展望 180

主要参考文献 180

第四章 动物基因组计划 202

第一节 概述 202

1动物基因组计划的启动 202

2动物基因组计划研究进展 205

第二节 家养动物基因组计划 217

1家蚕基因组计划 218

2鸡基因组计划 229

3狗基因组计划 235

第三节 动物的基因克隆和转基因动物 241

1动物的基因克隆 242

2转基因动物 249

第四节 克隆风波 257

1克隆动物 258

2克隆动物的意义 265

3克隆动物的问题 267

主要参考文献 273

第五章 微生物基因组计划 282

第一节 概述 282

1微生物基因组计划的启动 282

2微生物基因组计划研究进展 285

第二节 SARS冠状病毒（SARS-CoV） 300

1SARS-CoV分类及结构 301

2SARS-CoV基因组结构 306

3SARS-CoV基因组功能 310

第三节 禽流感病毒（AIV） 334

1AIV分类及结构 335

2AIV基因组结构 336

3AIV基因组功能 338

第四节 人免疫缺陷病毒（HIV） 347

1HIV分类及结构 349

2HIV基因组结构 351

3HIV基因组功能 352

第五节 其他微生物的基因组测序和应用 360

1极端抗辐射细菌 360

2异化的金属离子还原细菌 362

3耐高热古菌 364

主要参考文献 366

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