图书介绍：本书分8章，第1章，阐述序列比较的核心方法，即运用BLAST和ClustalX等工具做序列比对；第2章重点介绍了核苷酸序列分析工具，主要包括：基因预测，编码区结构分析，可变剪切分析，预测基因启动子，基因调控元件预测，密码子的偏好性分析等；第3章，蛋白质氨基酸序列分析从搜索数据库开始，随后对蛋白质基本理化性质、二级结构、结构域和三维空间结构、预测目标蛋白的生物功能等工具进行逐一介绍。第4章，使用TM4软件可实现芯片的数据采集，低质量过滤，标准化处理。GenMAPP软件则有助于挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义。第5章，简介GeneOntology和KEGG数据库，将分别有助于挖掘基因和蛋白的功能及其代谢途径分析。第6章，介绍分子进化遗传分析工具包，用MEGA4绘制系统发生树，为研究基因进化打好基础。第7章，利用X！Tandem软件鉴定蛋白质的串联质谱数据，再将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定出蛋白；借助TPP软件包进行统计学分析，优化检索结果。第8章，介绍Cytoscape系统生物学分析软件，展示蛋白－蛋白相互作用，并实现与基因表达等数据有机整合。书后附有专业词索引。